gnuplotに関しての追記

/形式を指定(PNG)
set terminal png
//ファイル名を指定
set output

//グラフのタイトル，軸ラベルの設定
set title "Title"
set xlabel "Xlabel"
set ylabel "Ylabel"

//X軸範囲，Y軸範囲の指定
//aからbの範囲を描画
set xrange [a:b]
set yrange [a:b]

//軸目盛りの指定（指定がない場合は自動設定される）
//目盛りの設定（値が軸に描画される）
set {x|y}tics 初期値,増分,終値
//細かい目盛りの区切り（値は軸には描画されない）
set m{x|y}tics 分割数

//plot

plot "file" using 1:2 title "line1" with linespoints

using 1:2
はそれぞれ1カラム目をX軸の値，2カラム目をY軸の値として割り当てる指定
1カラム目をX，3カラム目をYとしたければ　1:3のようにすればよい

複数のグラフを同時にプロットしたい場合は","で区切り，さらにplotを書けば良い

//保存，読み込み
save "savefilename"
load "loadfilename"